Os filos Nematoda( vermes arredondados) e Nematomorpha( vermes crina- de- cavalo) constituem o clado Nematoida. Assim como em outros táxons dos ecdisozoários, os nematoides não têm cílios locomotores e apresentam uma cutícula, que é substituída durante o crescimento.

Scalidophora é um clado dos ecdisozoários e junto com Nematoida é reunido em um clado mais amplo conhecido como Cycloneuralia. O clado Scalidophora inclui três filos: Kinorhynca, Priapula e loricifera.

Os quetognatos ( ou vermes em forma de flecha) abrangem cerca de 130 espécies marinhas, são invertebrados predadores, principalmente planctônicos. Possuem dimensões variando de 0,5 a 12 cm de comprimento.

Grupo monofilético, compreende 83% das espécies animais. O nome Ecdysozoa reflete a capacidade dos membros do grupo de realizarem ecdise, que é o processo de muda do exoesqueleto.