هیچ درمانی برای زگیل تناسلی وجود ندارد، اما داروهایی وجود دارد که می توانند زگیل ها را درمان کنند تا کمتر قابل رویت باشند. با این حال، تعداد بسیار محدودی از این داروها برای استفاده در دوران بارداری بی خطر اعلام شده اند.اگر داروهایی برای درمان زگیل تناسلی دارید که قبل از بارداری تان تجویز شده اند، پیش از مصرف آن ها باید با پزشک خود مشورت کنید. پزشک در صورتی که احساس کند برای شما و بارداری تان خطری ندارد، ممکن است درمان های موضعی را برای از بین بردن زگیل تناسلی در دوران بارداری تجویز کند.هرگز نباید زگیل تناسلی را توسط داروهای رفع زگیل بدون نسخه درمان کنید. این درمان ها می تواند موجب درد و تحریک بیشتر شود. زیرا این داروها خشن بوده و برای استفاده در بافت های حساس دستگاه تناسلی مناسب نیستند.اگر زگیل های بزرگی دارید و پزشک تان معتقد است می تواند زایمان تان را مختل سازد، ممکن است آن ها را از بین ببرد. از بین بردن زگیل به روش های زیر صورت می پذیرد:منجمد کردن زگیل ها با نیتروژن مایع (کرایوتراپی)جراحی برداشتن زگیل هااستفاده از جریان لیزر برای سوزاندن زگیل در اکثریت قریب به اتفاق زنان مبتلا به زگیل تناسلی، در دوران بارداری هیچ مشکلی به وجود نمی آید. همچنین خطر انتقال عفونت به جنین نیز بسیار کم است.اما در صورتی که به زگیل تناسلی یا هر گونه HPV مبتلا هستید و همچنان در مورد اثرات احتمالی آن بر بارداری تان نگران می باشید، با متخصص زنان زایمان یا مامای خود مشورت کنید. پزشک می تواند در مورد خطرات خاصی که ممکن است این مشکل داشته باشد و آن چه که برای تان مناسب تر است، به شما کمک کند. خطرات و هشدارهامهم است به یاد داشته باشید که خلاص شدن از زگیل تناسلی به این معنا نیست که شما دیگر این عفونت را ندارید. اگر چه نادر است، اما HPV می تواند منجر به ایجاد زگیل تناسلی و سرطان دهانه رحم شود. شما ممکن است بیش از یک نوع HPV داشته باشید. مهم این است که برای درمان زگیل های تان تحت نظارت پزشک باشد؛ حتی اگر آن ها را در خانه درمان کرده باشید.ویروسی که می تواند زگیل های تناسلی ایجاد کند، به مدت طولانی نیز می تواند در بدن شما به حالت تعلیق درآید. بنابراین چنانچه زگیل های تان را درمان کرده و از شر آن ها خلاص شده اید، باید بدانید که ممکن است مجددا به آن مبتلا شوید.