Secara umum terdapat 3 metode untuk mendapatkan tanaman jeruk bebas patogen secara in vitro, yaitu: Kultur Nuselus, Kultur Ovul, dan metode Shoot-Tip Grafting (STG). Metode STG bertujuan untuk mendapatkan induk semua spesies jeruk bebas dari sebagian besar virus, termasuk juga yang tidak tereliminasi oleh termoterapi. Karakteristik tanaman yang dihasilkan adalah tanaman yang nonjuvenil dan true-to-type.